南京市中心医院妇科位于医院门诊四楼，科内现拥有一支技术力量雄厚的医护队伍，高级职称三名、中级职称三名、初级职称两名。目前主要开展对妇科各种炎症、宫颈病变、阴道出血、子宫出血、痛经、月经不调、不孕、更年期综合症、子宫内膜异位症、子宫肌瘤、卵巢囊肿、子宫脱垂、尿失禁、慢性盆腔会阴痛、直肠痛等疾病的诊治，以及药流、无痛减压可视人流（采用一次性直视人流系统）、上环、取环术，阴道镜及宫腔镜检查，外阴阴道宫颈利普刀技术、宫腔镜下的（子宫粘膜下肌瘤切除、子宫内膜息肉切除、子宫腔粘连分离术等）微创手术、子宫切除、附件切除、子宫肌瘤剔除术、盆底疾病修复等多种手术。科室与南京市第一医院妇科合作，每周二下午开设以“盆底功能障碍性疾病”为主的特色专科门诊，对子宫脱垂、尿失禁、慢性盆腔会阴痛、直肠痛等盆底障碍性疾病进行诊断及微创手术治疗。